Sur cette hauteur, la famille d’Anlezy développe un château dans la seconde moitié du XVe siècle. 2 blasons sculptés, dont l’un porte les armes des d’Anlezy, conduisent à attribuer traditionnellement sa construction à Philibert d’Anlezy, sans qu’aucun acte ne le confirme. 

Le 19 novembre 1642, Paul-Léonard de Rémigny achète la terre et la seigneurie à Charles de Cossaye. Jean-Baptiste de Rémigny lance une grande campagne de construction et de transformation de la ferme. Les premiers paiements connus remontent à octobre 1777. Les principaux travaux s’achèvent en 1781, tandis que les finitions se poursuivent jusqu’en 1782. 

Le 31 août 1813 puis le 17 janvier 1814, Vincent Boucher, son beau-frère Louis Mourette et Pierre-Marie Levacher achètent Dumphlun. Le 29 septembre 1814, ils organisent un partage des lieux. Au XIXe siècle, Charles Boucher et ses fermiers orientent progressivement le domaine vers l’embouche et l’élevage. 

En 1888, la création de 32 hectares de prés supplémentaires fait passer les terres arables de 85 à 43 hectares. L’élevage du cheval de trait nivernais se développe également. Après le morcellement du domaine dans les années 1980, les bâtiments de la ferme sont rachetés en 2017. 

En 2021, M. et Mme Guény-Mentré sont identifiés comme propriétaires du terrain, et le site retrouve progressivement son unité. Le Loto du patrimoine lui apporte son soutien en 2021, pour la restauration de 2 granges sur 3.